ขณะเดียวกันกรมเจ้าท่า ยังได้ดำเนินการมาตรการป้องกัน เฝ้าระวัง ควบคุมการแพร่กระจายของเชื้อไวรัส ด้วยการออกประกาศกรมเจ้าท่าที่ 41/2563 เรื่องแนวปฏิบัติสำหรับเรือที่เข้ามาในน่านน้ำไทย กรณีเป็นเรือจากท้องที่นอกราชอาณาจักรที่เป็นเขตติดต่ออันตรายกรณีโรคติดเชื้อไวรัสโคโรน่า 2019 (COVID-19) จัดเจ้าหน้าที่ดำเนินการตรวจวัดอุณหภูมิ บริเวณจุดคัดกรองท่าเรือโดยสาร พร้อมบริการเจลแอลกอฮอล์ล้างมือ เพื่อฆ่าเชื้อโรค หากพบผู้มีความเสี่ยงให้ประสานงานส่งตัวโรงพยาบาลหรือสาธารณสุข จัดหาหน้ากากอนามัยและเจลแอลกอฮอล์ล้างมือ ให้กับเจ้าหน้าที่ประจำท่าเรือทุกท่า เพื่อสวมใส่ขณะปฏิบัติหน้าที่เพื่อป้องกันการแพร่ระบาดของเชื้อไวรัส COVID-19
อย่างไรก็ตาม ขอความร่วมมือประชาชนหากไม่มีความจำเป็นขอให้หยุดอยู่บ้านเพื่อลดความเสี่ยงการติดเชื้อไวรัสโควิด-19 หากต้องเดินทางขอให้ส่วมใส่หน้ากากอนามัยตลอดเวลา พกเจลล้างมือซึ่งในส่วนของเรือโดยสารยืนยันให้บริการตามปกติ